농촌진흥청은 2009년부터 전국의 메주에서 곰팡이를 선발해 특성을 분석하고 구수한 전통 장맛을 내는 곰팡이 종균 균주(KACC 93210)를 개발했다.
국내에 유통되는 장류 제조 종균은 대부분 일제강점기에 일본에서 들여온 것으로, 일부 기업에서 곰팡이 종균을 개발해 자체적으로 사용하고 있는 것 외에 소규모 업체나 농가에서 사용할 수 있는 토종곰팡이 종균은 개발되지 않았다.
이에 농촌진흥청은 2009년부터 제주도를 포함한 전국의 다양한 메주에서 곰팡이 101종 1,479균주를 수집하고, 장류 제조 특성이 우수한 10종의 곰팡이를 선발해 특허 출원했다.
이 곰팡이를 유전자 분석한 결과, 국내에 유통되는 기존의 일본 유래 종균과는 명확한 차이를 보였으며, 세계적으로 보고된 다른 종균들과 유전적 차이를 보이며 한국 토종임을 확인했다.
농촌진흥청은 이번에 개발한 곰팡이를 특허 출원하고, 국내 곰팡이 종국 전문 제조회사에 기술 이전해 시제품을 생산하고 있다. 이 종균을 사용해 장류를 생산하고자 하는 장류 업체나 농가는 국내 종국회사에서 구매하면 된다.